层面下应当处理纠纷的方式如下：
1.协商。知识纠纷当事人双方协商后，对纠纷问题有了一个解决方式，达成一个和解协议。
2.调解。知识产权纠纷当事人一方或者双方申请，由法院、仲裁机构或调解人在当事人进行协调，之后对纠纷达成协议，解决知识产权纠纷。
3.处理。这个是到知识产权行政管理机关处进行处理，也就是处理知识产权纠纷或者与知识产权有关的行为等违法行为的活动。
4.仲裁。首先当事人愿意通过仲裁，将纠纷提交给仲裁机构进行审理，然后仲裁机构对双方争议的地方进行处理，作出仲裁裁决或者调解书。之后由知识产权纠纷的当事人进行履行。
5.诉讼。双方当事人对知识产权纠纷问题不能够协商、调解等情况下，当事人可以到法院进行起诉。
二、 知识产权纠纷由谁管辖法务时刻提醒您，侵犯由侵权行为的实施地、侵权商品的储藏地或者查封扣押地、被告住所地的中级人院管辖。专利纠纷第一审案件，由各省、自治区、直辖市人民政府所在地的中级人民法院和最高人民法院指定的中级人民法院管辖。侵害著作权的，由侵权行为的实施地、侵权复制品储藏地或者查封扣押地、被告住所地人民法院管辖。
三、 怎样避免知识产权纠纷1.对于基础的知识产权相关文件应进行有效管理（来源时间、保管、使用、废弃），并建立完整的分类分级管理制度；
2.企业应就保密事宜单独与员工，约定劳动者负有保守用人单位知识产权或商业秘密不对外泄露的义务。另外企业应对新员工入职时的知识产权状况进行调查；
3.企业应建立妥善的知识产权预警机制，监察己方或其他企业可能出现的侵权行为；
4.企业在立项前应该进行必要的知识产权检索和分析，确认侵权风险。
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