肛门内部隐隐作痛可能是肛裂、内痔、肛窦炎、肛管直肠周围脓肿、血栓性外痔、直肠癌等肛肠疾病引起，也可能是其他原因，建议及时就医，明确诊断。
1.肛裂
肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，常引起肛门疼痛。
2.内痔
肛垫的支持结构、静脉丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位，被认为是内痔形成的主要因素。内痔通常无明显疼痛，当内痔或混合痔脱出嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，则会导致肛门疼痛。
3.肛窦炎
肛窦炎是引起肛门部下坠疼痛的最常见原因之一。此外，还伴有肛门部潮湿、瘙痒等不适。
4.肛管直肠周围脓肿
是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。其特点是自行破溃，或在手术切开引流后常形成肛瘘。
5.血栓性外痔
肛门部突然剧烈疼痛，并出现暗紫色肿物。
6.直肠癌
肛门部有下坠感，大便次数增多，大便变细，带黏液或带血，继而出现便秘、腹泻交替出现等症状。
需要注意的是，引起肛门内部隐隐作痛的原因还有很多，如肛门直肠神经官能症、肛管直肠癌等。因此，如果出现肛门内部隐隐作痛的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、老年人、长期便秘或腹泻患者等，更应重视肛门内部隐隐作痛的症状，及时就医，以便早期发现和治疗肛肠疾病。此外，保持良好的生活习惯，如适量运动、饮食清淡、避免久坐等，也有助于预防肛肠疾病的发生。
