纠纷的正确处理方法是：
1.知识纠纷发生后，双方自行协商；
2.知识产权纠纷发生后，经双方申请，由人院、仲裁机构或者调解人协调；
3.知识产权纠纷发生后，当事人或者非特定第三人要求知识产权行政机关处理知识产权纠纷；
4.知识产权纠纷发生后，将纠纷提交仲裁机构审理，仲裁机构制定对纠纷双方都有约束力的裁决制度；
5.知识产权纠纷发生后，向法院起诉。
二、 知识产权纠纷的诉讼时效法务时刻提醒您，知识产权诉讼的时效是三年。根据相关规定，侵犯、著作权、的诉讼时效为三年。并且该诉讼时效自利权人或者相关利害关系人知道或者应当知道行为以及侵权人之日起计算。
《中华人民共和国专利法》第七十四条
侵犯专利权的诉讼时效为三年，自专利权人或者利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
申请公布后至专利权授予前使用该发明未支付适当使用费的，专利权人要求支付使用费的诉讼时效为三年，自专利权人知道或者应当知道他人使用其发明之日起计算，但是，专利权人于专利权授予之日前即已知道或者应当知道的，自专利权授予之日起计算。
三、 知识产权纠纷的种类1.归属权纠纷。这个就是问谁才是知识产权的权利人，谁才是真正的人，谁应该具有这个争议的知识产权的所有。是单方知识产权人还是共同知识产权人等纠纷。
2.侵权纠纷。这种情况是知识产权人和不特定的第三人因为侵权行为而发生的争议，我们可以理解为没有经过授权（知识产权人）许可，自己擅自使用知识产权，自己从中获得利益。
3.。这种就是在知识产权转让、知识产权许可使用过程中签订的合同，合同当事人因为合同而引起的争议。
4.行政纠纷。知识产权当事人不服知识产权行政管理机关所作出的决定，而由此产生的纠纷。
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