软件著作权合同登记费用是每次100元。申请人自动撤回申请或者登记机关不予登记的，所交费用不予退回。 申请人向中国版权保护中心邮寄的各种文件，以寄出的邮戳日为递交日。信封上寄出的邮戳日不清晰的，除申请人提出证明外，以收到日为递交日。
一、软件著作权合同登记费用是多少?
1、计算机软件费
250元/件次。该项目费用只限于程序及其一种文档的登记，如申请登记多种文档，每增加一种文档，增收80元。
例外交存手续费320元/件次。
2、软件著作权合同登记费
每次100元
3、软件著作权合同登记证书费
50元/件
4、版权变更或补充登记费
150元/件次
5、请求延期处理费
第一次100元/件次，第二次200元/件次
6、软件源程序封存保管费
100页为120元，超过100页的，每增加1页增收2元
二、申请软件著作权登记需要什么材料?
1、软件著作权转让合同或者专有许可合同当事人可以向中国版权保护中心申请合同登记。申请合同登记时，应当提交以下材料：
(1)按要求填写的合同登记表;
(2)合同复印件;
(3)申请人身份证明。
申请人在登记申请批准之前，可以随时请求撤回申请。
2、软件著作权登记人或者合同登记人可以对已经登记的事项作变更或者补充。申请登记变更或者补充时，申请人应当提交以下材料：
(1)按照要求填写的变更或者补充申请表;
(2)登记证书或者证明的复印件;
(3)有关变更或者补充的材料。
三、申请软件著作权登记的作用是什么?
软件著作权是企业的无形资产之一，它与、一起构成企业的，是企业投资、入股、融资等的有效无形资产;是企业申请软件产品登记的先决条件。同时便于企业认证软件企业和享受政府对企业的各种扶持和优惠政策;在销售、许可转让和无形财产评估中具有重要作用。
软件著作权即软件开发完成之日起就自动产生，登记并不是权利产生的必要条件。但在发生软件著作权争议时，如果不经登记，著作权人很难举证说明软件完成的时间以及所有人。
综上所述，软件著作权登记是保护的重要手段，办理著作权登记涉及到一些费用，比如合同登记费，根据目前标准是每件100元。这里要注意，软件著作权在软件设计完成后就产生，登记也不是必须的程序，但是如果没有登记之后发生纠纷的话，当事人维权会比较困难。
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