如果学校制定的关于后勤员工加班工资发放方案违法，可以向当地的劳动行政主管部门投诉，《劳动法》规定，公司制定的相关规章制度违反规定的，劳动行政主管部门应该对公司进行警告，如果相关规定已经损害了劳动者合法权益，公司应该承担相应的赔偿责任。

一、学校后勤员工加班工资发放方案违法怎么办?

学校后勤员工加班工资发放方案违法的，可以向劳动行政部门投诉。

《劳动法》第八十九条 用人单位制定的劳动规章制度违反法律、法规规定的，由劳动行政部门给予警告，责令改正;对劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。

二、加班工资的计算依据是什么?

(一)安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬;

(二)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬;

(三)法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

三、后勤员工被拖欠加班工资申请仲裁需准备哪些材料?

1、申请书。

2、申请人身份证明及复印件。

3、有委托代理人的，需当面签定并提交《授权委托书》，注明委托事项，同时提交受委托代理人的身份证复印件。

4、被申请人工商注册信息资料。

5、申请人与被申请人存在的证明材料。

6、《提交证据材料清单》一式两份。

四、后勤员工被拖欠加班工资的仲裁流程有哪些?

1、提交申请书：当事人申请仲裁，应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。

2、仲裁受理：应当自收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的决定。仲裁委员会决定受理的，应当自作出决定之日起五日内将申诉书副本送达被申请人。决定不予受理的，应当说明理由。

3、开庭审理：仲裁庭应当于开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人。无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，对申请人按照撤诉自理，对被申请人可以做缺席裁决。

4、仲裁调解：仲裁庭处理劳动争议应当先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。调解达成协议的，仲裁庭应当根据协议内容制作调解书，调解书自送达之日起具有法律效力;调解未达成协议的，仲裁庭应当及时裁决。

5、仲裁裁决：仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经批准可以延期并书面通知当事人，延长期限不超过十五日。仲裁庭裁决后应当制作仲裁书送达双方当事人。当事人对仲裁裁决不服的，自收到裁决书之日起十五日内，可以向人院起诉;期满不起诉的，裁决书即发生法律效力。

事实上，不管员工的工作岗位具体是怎样的，加班工资的发放标准都是国家法律制度明确规定的，比如国家规定的法定节假日的加班工资是平时工资收入的三倍，但是学校制定的发放方案却是按照工资收入的两倍计算的，这样的发放方案并不具有任何法律效力。

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